Bioconversion of α-chitin into N-acetyl-glucosamine using chitinases produced by marine-derived Aeromonas caviae isolates.

N-Acetyl-D-glucosamine (GlcNAc) is a monosaccharide with great application potential in the food, cosmetic, pharmaceutical, and biomaterial areas. GlcNAc is currently produced by chemical hydrolysis of chitin, but the current processes are environmentally unfriendly, have low yield and high cost. This study demonstrates the potential to produce GlcNAc from α-chitin using chitinases of ten marine-derived Aeromonas isolates as a sustainable alternative to the current chemical process. The isolates were characterized as Aeromonas caviae by multilocus sequence analysis (MLSA) using six housekeeping genes (gltA, groL, gyrB, metG, ppsA, and recA), not presented the virulence genes verified (alt, act, ast, ahh1, aer, aerA, hlyA, ascV and ascFG), but showed hemolytic activity on blood agar. GlcNAc was produced at 37 °C, pH 5.0, 2% (w/v) colloidal chitin and crude chitinase extracts (0.5 U mL-1) by all the isolates with yields from 14 to 85% at 6 h, 17-89% at 12 h and 19-93% after 24 h. The highest yield of GlcNAc was observed by A. caviae CH129 (93%). This study demonstrates one of the most efficient chitin enzymatic hydrolysis procedures and A. caviae isolates with great potential for chitinases expression and GlcNAc production.

Draft Genome Sequence of Aeromonas caviae CH129, a Marine-Derived Bacterium Isolated from the Coast of São Paulo State, Brazil.

We report here the draft genome sequence of Aeromonas caviae CH129, a marine-derived bacterium isolated from the coast of São Paulo state, Brazil. Genomic analysis revealed genes encoding enzymes involved in binding, transport, and chitin metabolism and different virulence-associated factors.

Draft Genome Sequence of Marine-Derived Aeromonas caviae CHZ306, a Potential Chitinase Producer Strain.

We report here a draft genome sequence of Aeromonas caviae CHZ306, a marine-derived bacterium with the ability to hydrolyze chitin and express high levels of chitinases. The assembly resulted in 65 scaffolds with approximately 4.78 Mb. Genomic analysis revealed different genes encoding chitin-degrading enzymes that can be used for chitin derivative production.

Detecção de Salmonella spp. em mexilhões Perna perna dos bancos naturais de baía densamente urbanizada / Salmonella spp. detection in brown mussels Perna perna from natural sea beds of a densely urbanized bay

O objetivo deste estudo foi detectar a presença de Salmonella spp. em amostras de mexilhão Perna perna(L.) de bancos naturais da Ilha das Palmas, Baia de Santos, São Paulo, Brasil. No período de agosto de 2010 a julho de 2011 foram realizadas dez coletas de mexilhões Perna perna de três pontos distintos, no total de 29 amostras. Estas foram processadas segundo a metodologia descrita no Compendium of Methods forthe Microbiological Examination of Foods. A Salmonella spp. foi isolada em 20,7 por cento das amostras analisadas. As cepas de Salmonella spp. apresentaram quatro diferentes sorotipos dentre os seis isolados. O sorotipo dominante foi o S. Livingstone, detectado em três (50 por cento) amostras, e os demais (S. Infantis, S. enterica subsp.salamae e S. Albany) foram isolados de uma amostra (16,6 por cento). Salienta-se que em cada um dos pontos de coleta foram isoladas duas cepas distintas de Samonella spp,; no ponto 1 S. Livingstone e S. Albany, ponto 2S. Infantis e S. Livingstone, e ponto 3 S. enterica subsp. salamae e S. Livingstone. A S. Livingstone foi isolada em amostras de três pontos, duas no mês de janeiro de 2011 e uma no mês de junho de 2011.

Viabilidade da aplicação do método respirométrico de Bartha para determinação da biodegradação de poluentes ou resíduos em latossolos / Feasibility of application of Bartha's respirometric method to determine biodegradation of pollutants or wastes in latosoils

Para avaliar a possibilidade de biorremediação em áreas contaminadas, é necessário determinar a biodegradação dos poluentes no solo. Para esta determinação, emprega-se comumente no Brasil, o método respirométrico de Bartha, adaptado de uma norma holandesa. Porém, os solos tropicais possuem características bem diferentes dos solos de regiões de clima temperado. Neste trabalho, foi estudada a aplicabilidade de tal método para um latossolo, tipo de solo predominante no Estado de São Paulo. A partir dos resultados obtidos, foi possível verificar que reações abióticas geram gás carbônico em quantidades significativas. Constatou-se, também, a dificuldade de esterilização do solo em autoclave, o que impossibilita a avaliação da remoção dos poluentes por outros mecanismos ou a biodegradação dos mesmos por microrganismos exógenos somente. Portanto, não se recomenda a aplicação do teste respirométrico de Bartha para a determinação da biodegradabilidade de poluentes em latossolos.

One of the major parameters that influence the feasibility of using bioremediation in contaminated sites is the biodegradability of the compounds of concern. The Bartha's respirometric method, adapted from a Dutch norm, is a common method used in Brazil to determine such biodegradability. However, tropical soils present different characteristics as compared to soils from regions of temperate climate. In this research, its applicability was studied for a latosoil, which is the predominant soil type in São Paulo State, Brazil. Based on the results of this study, it can be concluded that abiotic reactions in latosoil generated carbonic gas in significant concentrations. Furthermore, this research verified the difficulty of sterilizing the soil, which would make it difficult to evaluate the removal of contaminants by other mechanisms or the biodegradation by exogenous microorganisms. Therefore, the application of BarthaÆs respirometric method is not recommended to determine the biodegradability of pollutants in latosoils.